lammps在轨迹中，不同单位下在轨迹中输出原子温度
・温度
metal单位时
compute KE all ke/atom
variable KB equal 8.625e-5
variable TEMP atom c_KE/v_KB
fix properties all ave/atom 50 60 3000 v_TEMP
dump 1 ……继续阅读 »
shijm89
3周前 (12-01) 19浏览 0评论
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https://kikajia.com/
https://scrapbox.io/k1ito/Preferred_Networks%E3%81%A8%E3%81%84%E3%81%86%E6%9C%80%E9%AB%98%E3%81%AE%E4%BC%9A%E7%A4%BE%E3%81%AB%E6%96%B0%E5%8D%92%E5%85%A5%E7%A4%……继续阅读 »
shijm89
1年前 (2023-07-27) 231浏览 0评论
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adduser name
sudo usermod -a -G sudo hduser
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shijm89
2年前 (2023-04-16) 437浏览 0评论
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力场信息汇总
ClayFF
TRAPPE
http://trappe.oit.umn.edu/
Pcff
PVDF
1L水的摩尔数55.55555556mol
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shijm89
2年前 (2023-02-13) 272浏览 0评论
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cif to data
可以从cif直接生成data文件，生成的data不含键角，适用于金属和不含键角的氧化物体系
需要安装python环境，和python ase包
from ase.io import read,write
name = "SiC2"
atoms = read(name+'.cif')
w……继续阅读 »
shijm89
2年前 (2023-02-13) 233浏览 0评论
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问题汇总
Out of range atoms – cannot compute PPPM
解决方法
neigh_modify delay 0 every 1 check yes
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shijm89
2年前 (2023-02-13) 246浏览 0评论
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Lammps反应力场文件
Si/C/S/O
适用于SiC H2O O2
https://doi.org/10.1021/jp306391p
Oxidation of Silicon Carbide by O2 and H2O: A ReaxFF Reactive Molecular Dynamics Study, Part I
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shijm89
2年前 (2023-02-12) 240浏览 0评论
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https://www.intel.com/content/www/us/en/developer/articles/technical/building-vasp-with-intel-mkl-and-intel-compilers.html
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shijm89
2年前 (2023-02-11) 251浏览 0评论
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1、准备工作
Win10系统下安装WSL2 ubuntu2204
在ubuntu内安装cuda驱动
wget https://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/ubuntu2204/x86_64/cuda-keyring_1.0-1_all.deb
sudo dpkg -i cuda-keyr……继续阅读 »
shijm89
2年前 (2023-02-09) 281浏览 0评论
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https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jpclett.0c01553
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shijm89
2年前 (2022-07-30) 282浏览 0评论
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